同一所学校可以申请两个program吗

LZ是学MIS的，对于dream school CMU有两个想申请的program, 分别是Heinz School下的MISM和CS下的eBiz。
但今天听同学讲同一所学校申请两个不同的program可能会影响学校对你的印象，觉得不够真诚？？
因为成绩寄送什么的好多都是直接寄到学校而非特定院系。
想问一下地里众亲的经验。
谢谢啦！