老师推荐信只推荐Phd项目

找老师要推荐信，老师一口答应了。最后开头写的是推荐我读phd program。本来我是申请MS的，老师说MS需要啥推荐信，他只写Phd的，我该怎么办呢？再换申请人貌似晚了。