OPT 90天超过了3天怎么办？！！

大家好。
我OPT 90天期限4月30号到期的，在这之前我申请了一个non-profit组织的un-paid职位，offer里面写的是part-time 24个小时每周。我报给学校以后一直没有通过。 然后我5月3号拿到了full-time offer。我就问了下学校怎么报（因为之前part-time那个是pending状态要报新的只能cancel掉）。然后OIS工作人员就回复我说那个part-time的没有用，他给我把那个取消掉了让我报这个新的。这个新的他很快就帮我update了，之后告诉我说我以后可能会遇到问题因为我超出90天了。

PS：90天是从opt开始时间算起，到拿到offer的时间还是开始工作的时间？

谢谢各位！