环境工程 一般985 弱GPA 求选校建议

实习虽然有三段但是都很水很短，1-2个月那种，一段国内top2的实验室实习，两段设计院实习（其中一个为三桶油之一的安全评价部门）
但有一个很严重的问题是在UW交换的一年，最后一个quarter没弄好，有一门microbiology的intro课太难了，改成S/NS（类似pass/non-pass）之后不幸地没过线，成绩单上有个NS，不知道影响大不大，每天都很担心纠结选校。。。
此外还在纠结推荐信是请UW的教授（只是上了课，问了问问题，最后考试3.4/4.0，很可能是普通推）还是国内随便找一个任课老师强推。。
希望大家给点意见！以及选校的定位~谢谢！

补充内容 (2017-8-7 17:42):
其实还有一段UCI的暑校，但选的课和本专业都没啥关系而且成绩单找不到了，还有必要写进CV里吗？
目前选了学校有哥大、康奈尔、西北、JHU、杜克、卡梅和UCI。有点藤校情节hh~