H1B Consular Notification 疑问

公司律师说，consular notification就是需要出境，再入境换H1B （如果抽中的话），不能在美国国内自动转。请问，这个和普通的H1B petition有什么区别 （优劣）吗？

我的背景是这样的：去年年底毕业，最近刚刚入职，公司的律师在帮弄今年H1B抽签的事。
因为我在本科最后一年，通过学校交换项目 J1签证到美国交换一个学期，签证要求two-year home-country physical presence requirement
后来再申请到美国读Ph.D 就把这个J1 waiver给忘了。。。


去年毕业前经别人提醒，12月初 才寄出去这个J1 waiver。目前中国领事馆已经批准，全等着美国国务院批了。。但是眼见着H1B file （4.1）前，
是不太可能收到J1 waiver批准了，所以公司律师说 只能申请这个consular notification，不知道有什么区别？