美国公司继续付工资通过w9，会影响以后的L签吗

今年最后一次h1b抽签没中，所以要回国工作一年。由于某些原因，我的工资的一部分任将由美国公司支付，公司给了我个W9表。我担心将来申请L签的时候，签证官会不会怀疑我还一直在为美国公司工作啊？有没有其他战友跟我一样的情况？