华盛顿大学UW计算机系远程实习ML/NLP/Comp Bio

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各位同学大家好!我将于2021年1月加入华盛顿大学计算机学院成为一名助理教授,这是我的个人主页 web.stanford.edu/~swang91/
我想找愿意和我在暑假期间(从现在开始到9月底)一起做科研的同学来共同完成一些项目。

我的科研方向是open-world biomedical discovery。这是一个高度交叉的新方向,结合了machine learning,nlp,computational biomedicine。未来还会有system的实现和theory的支持。其中还有security,database,hci各个方向的应用。可以说所有cs的方向,甚至科学方向都会用到其中。
如果大家玩过开放世界电脑游戏,比如gta5这种,就一定对open world不陌生了。open world游戏要比closed world游戏更自由,更有趣,但开发起来也更有难度。
我的目标就是开发open world biomedical discovery system。例如我们有一个癌症病人数据集,我们观察到其中80%的病人分别是乳腺癌,肝癌和肺癌。那么当我们用ml model来预测剩下20%的病人的时候,就会by default把剩下的病人也预测成为这三种癌症的一种,但这些病人可能是其他癌症。现实生活中,会因为follow closed world assumption导致大量医疗健康问题,比如罕见疾病,新疾病,新药物都无法进行有效预测和研究。我的科研就是用ml,nlp和comp bio来让科学家医生在open world的环境下做研究,从而让我们能快速的对新疾病、新症状、新药物作出反应。

在这个大背景下,我有一些具体的项目,每个的完成周期是三个月左右。我想找一些对我科研感兴趣的同学,每个人负责一个具体项目,我会努力帮同学们把每个具体项目都变为一个first author paper。

对感兴趣的同学的要求:
1. 能投入大量时间,至少每周40小时,持续2个月-3个月,不会半途而废。如果你愿意投入大量时间,我会相应的投入大量时间指导你,帮你完成这个paper。我会负责选题,帮助你建立ml model和公式推导,帮助你一起写作paper。
2. 有较强编程能力,比如给你一个paper,可以快速把他们的github code跑通,然后改进代码。
3. 数学和ml背景。希望你读过(或者能轻松读懂)Pattern Recognition and Machine Learning这本书。然后能快速读懂一篇新ml/nlp paper(比如MAML,bert)。
4. 生物医学背景不需要。但如果你有这方面背景/兴趣,还有很强的ml能力,那我们可以一起做一个长期项目(1年),然后投一个非常好的期刊(nature 子刊)。也欢迎这样背景的同学来申请我的phd。

你的收获:
1.我没有那种需要同学帮忙的大project,也没有工程开发类的project,每个项目都是冲着投一个好的论文去的。所以每个学生会和我两个人做一个project,然后成为自己paper的first author。如果6月开始和我做实习,我计划10月底投稿。
2. 如果我们合作的愉快,我也会尽我所能帮助你以后的申请。
3. 科研训练。从选题,到ml model,到paper写作,我都会努力指导。所以我很欢迎有很好的数学编程基础,但没有太多科研训练的同学。
4. cutting edge的project。我本人现在在斯坦福医学院读postdoc,所以接触了很多有重大实际意义的生物医学问题(癌症药物开发,新生儿罕见病检测等),我们的科研会以解决这些问题为目标。

如果有兴趣的同学,请把cv,github link,成绩单发给,谢谢!email title: summer internship 我的email swang91 [at] stanford (dot) edu
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