读博期间独立发表的论文（或者没有导师挂名）的文章可以放入Thesis吗？

有个小小的好奇，在读博期间自己独立写的或者跟朋友合作的文章也可以算作thesis的一部分吗？
前提当然是不拿RA（纯做TA或者拿fellowship），不用老板的资源，毕竟CS也就是推公式做实验搞开源。另一个平行的问题就是非一作文章（比如二作）也可以包含在thesis中吧？

好奇的是有没有某种约定俗成thesis中的内容必须是和老板合作完成的，甚至一作文章才算（虽然可能不同学校不同系之间也有差别）？我自己猜这些可能并没有什么严格的界定，了解一下大家的观点。
感谢~

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主要是受到了一篇知乎提问的启发：zhihu.com