关于CS方向PhD和Master的纠结！

我是清华自动化系大三升大四的学生，打算申请2014Fall入学，最近一直在纠结选校的问题。我GPA只有84/100，T107，G153+168+3.5（打算重考），参加过几个项目，没paper，好的PhD估计够呛，咨询过一位学长他说可以申Master然后转PhD，想知道一下这个可行度怎么样？听很多人说可行度挺高的，只要有钱。不过看了几个学校的官网，比如CMU，Cornell，Yale之类的，都说Master和PhD没什么关系，Master的学生也要重新申请才能读PhD，想问一下可以直接转成PhD吗？还有，cornell的CS的Master是M.eng，读这个的话转PhD是不是比较困难？