计算机冷门PhD 科研疑惑求指导

情况是这样 现在刚开始博三 然后手里一篇文章都没。。。

我也急啊 可是没用 小转专业算是 EE转计算机系统/安全/分析 代码底子不厚
我的科研基本就是在自己搞 然后和老板单独开会 我们人比较少 没有组会
但越学越迷茫啊。。牵扯到的随便一个topic都是大块头 感觉没有多年的经验根本玩不转
大概现在需要两到三个这样的专长才可以游刃有余 可根本没时间学。。
老板不算push 但是一直盯着我用一个别人的工具 那个工具很好很强大(与我无瓜) 我要用他的然后来应用在我的topic上 可是周围没人懂这个 所以一直都是我自己摸索 磕磕碰碰算懂了咋用
然后这不是快开题了 老板突然让我把手头的工作整理一下弄个paper出来 我真是一口老血喷出来了
是因为我觉得手头那些最多算个使用指南。。还不一定对 这怎么做成paper呢 好多细节我都没搞明白 要是能发出去不是让人笑话是外行
然后就头挺大的。。越来越焦虑 头发一把一把掉啊 整宿睡不着 因为我大概只修改了一二百行的代码(工具代码量大概总共几十万行 与我有关的几万行） 这能算什么工作？ 觉得水的不行 尤其是在准备这个paper的时候读了很多大神的 越读后脑勺越凉 倒不是说跟大神们比 是我真心觉得自己的工作还不如一个计科本科生的大作业水平 这也能发paper？
总结一下问题，希望各位不吝解惑：
1.这种tool use paper 能算paper吗。。。是什么水平？包括我修改的代码看着都巨弱智
2.我研究的需要c/c++但是我基本没什么基础 当c with class一样在用 本身是python入门的 现在想恶补c++ 应该怎么针对性训练呢? 我指的是 刷题找项目做 or 盯着我研究用的工具 一点点啃 前者有点占时间
3.如何摆脱反抗情绪 说真的我现在很排斥用那个tool 有点心理阴影 很强的畏难情绪 可是我不该有。。

提前祝各位新年快乐~！顺风顺水